Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rab5aQ9CQD1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms