Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Chchd1Q9CQA6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Chchd1Q9CQA6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Chchd1Q9CQA6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Chchd1Q9CQA6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Chchd1Q9CQA6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chchd1Q9CQA6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chchd1Q9CQA6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chchd1Q9CQA6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chchd1Q9CQA6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chchd1Q9CQA6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chchd1Q9CQA6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chchd1Q9CQA6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chchd1Q9CQA6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chchd1Q9CQA6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chchd1Q9CQA6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chchd1Q9CQA6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chchd1Q9CQA6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chchd1Q9CQA6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chchd1Q9CQA6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Chchd1Q9CQA6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chchd1Q9CQA6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Chchd1Q9CQA6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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