Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pkp2Q9CQ73 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pkp2Q9CQ73 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pkp2Q9CQ73 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms