Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ70

H2afb1, Histone H2A-Bbd type 1, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afb1Q9CQ70 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2afb1Q9CQ70 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afb1Q9CQ70 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms