Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ47

4921530L21Rik, RIKEN cDNA 4921530L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921530L21RikQ9CQ47 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4921530L21RikQ9CQ47 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
4921530L21RikQ9CQ47 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.7 ms