Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ46

Efcab2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab2Q9CQ46 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Efcab2Q9CQ46 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Efcab2Q9CQ46 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Efcab2Q9CQ46 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Efcab2Q9CQ46 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Efcab2Q9CQ46 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Efcab2Q9CQ46 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Efcab2Q9CQ46 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Efcab2Q9CQ46 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms