Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnaseh2cQ9CQ18 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Rnaseh2cQ9CQ18 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Rnaseh2cQ9CQ18 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rnaseh2cQ9CQ18 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rnaseh2cQ9CQ18 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rnaseh2cQ9CQ18 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnaseh2cQ9CQ18 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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