Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Chmp3Q9CQ10 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Chmp3Q9CQ10 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Chmp3Q9CQ10 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
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