Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Krt88Q9CPR6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms