Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rrbp1Q99PL5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rrbp1Q99PL5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rrbp1Q99PL5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rrbp1Q99PL5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rrbp1Q99PL5 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Rrbp1Q99PL5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Rrbp1Q99PL5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rrbp1Q99PL5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Rrbp1Q99PL5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Rrbp1Q99PL5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rrbp1Q99PL5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rrbp1Q99PL5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rrbp1Q99PL5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rrbp1Q99PL5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Rrbp1Q99PL5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rrbp1Q99PL5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rrbp1Q99PL5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rrbp1Q99PL5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms