Protein–RNA interactions for Protein: Q99PB1

1700020D05Rik, Mage-g2, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700020D05RikQ99PB1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700020D05RikQ99PB1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
1700020D05RikQ99PB1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
1700020D05RikQ99PB1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
1700020D05RikQ99PB1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700020D05RikQ99PB1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700020D05RikQ99PB1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700020D05RikQ99PB1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700020D05RikQ99PB1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700020D05RikQ99PB1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700020D05RikQ99PB1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700020D05RikQ99PB1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700020D05RikQ99PB1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700020D05RikQ99PB1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700020D05RikQ99PB1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700020D05RikQ99PB1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700020D05RikQ99PB1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
1700020D05RikQ99PB1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700020D05RikQ99PB1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700020D05RikQ99PB1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700020D05RikQ99PB1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700020D05RikQ99PB1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
1700020D05RikQ99PB1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
1700020D05RikQ99PB1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms