Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rtn4Q99P72 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Rtn4Q99P72 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.8 ms