Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rassf3Q99P51 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rassf3Q99P51 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms