Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Bco2Q99NF1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bco2Q99NF1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bco2Q99NF1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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