Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atoh8Q99NA2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Atoh8Q99NA2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms