Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Mrpl3Q99N95 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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Mrpl3Q99N95 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl3Q99N95 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms