Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4dQ99N05 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms