Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SrrtQ99MR6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SrrtQ99MR6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms