Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
BrapQ99MP8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BrapQ99MP8 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms