Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm2d1Q99MB3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm2d1Q99MB3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm2d1Q99MB3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm2d1Q99MB3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm2d1Q99MB3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm2d1Q99MB3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm2d1Q99MB3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm2d1Q99MB3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm2d1Q99MB3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm2d1Q99MB3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm2d1Q99MB3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tm2d1Q99MB3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tm2d1Q99MB3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms