Protein–RNA interactions for Protein: Q99M71

Epdr1, Mammalian ependymin-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epdr1Q99M71 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Epdr1Q99M71 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Epdr1Q99M71 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms