Protein–RNA interactions for Protein: Q99LZ3

Gins4, DNA replication complex GINS protein SLD5, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins4Q99LZ3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gins4Q99LZ3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gins4Q99LZ3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms