Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cmtm3Q99LJ5 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cmtm3Q99LJ5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms