Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Q99KU6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q99KU6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q99KU6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Q99KU6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q99KU6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q99KU6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q99KU6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q99KU6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q99KU6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q99KU6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q99KU6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q99KU6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q99KU6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q99KU6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q99KU6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q99KU6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q99KU6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q99KU6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q99KU6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q99KU6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q99KU6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q99KU6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q99KU6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Q99KU6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Q99KU6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Q99KU6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q99KU6 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q99KU6 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q99KU6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q99KU6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q99KU6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q99KU6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q99KU6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q99KU6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q99KU6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q99KU6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Q99KU6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q99KU6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q99KU6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q99KU6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q99KU6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q99KU6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q99KU6 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q99KU6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q99KU6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q99KU6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q99KU6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Q99KU6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q99KU6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q99KU6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q99KU6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q99KU6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q99KU6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q99KU6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q99KU6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q99KU6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Q99KU6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Q99KU6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q99KU6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q99KU6 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q99KU6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q99KU6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q99KU6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q99KU6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q99KU6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q99KU6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q99KU6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q99KU6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q99KU6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q99KU6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q99KU6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q99KU6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Q99KU6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q99KU6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q99KU6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q99KU6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q99KU6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q99KU6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q99KU6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q99KU6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q99KU6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q99KU6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q99KU6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q99KU6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q99KU6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q99KU6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q99KU6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Q99KU6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q99KU6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q99KU6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q99KU6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q99KU6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q99KU6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q99KU6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Q99KU6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q99KU6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q99KU6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q99KU6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Q99KU6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms