Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf34Q99KR6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf34Q99KR6 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms