Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prpf19Q99KP6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prpf19Q99KP6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms