Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Clint1Q99KN9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Clint1Q99KN9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms