Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tmed9Q99KF1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tmed9Q99KF1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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