Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pacsin3Q99JB8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pacsin3Q99JB8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms