Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CsprsQ99388 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CsprsQ99388 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CsprsQ99388 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CsprsQ99388 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CsprsQ99388 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CsprsQ99388 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CsprsQ99388 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CsprsQ99388 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CsprsQ99388 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CsprsQ99388 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CsprsQ99388 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CsprsQ99388 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CsprsQ99388 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CsprsQ99388 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CsprsQ99388 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CsprsQ99388 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CsprsQ99388 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CsprsQ99388 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CsprsQ99388 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CsprsQ99388 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CsprsQ99388 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CsprsQ99388 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CsprsQ99388 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CsprsQ99388 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CsprsQ99388 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CsprsQ99388 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CsprsQ99388 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CsprsQ99388 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CsprsQ99388 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CsprsQ99388 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CsprsQ99388 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms