Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
SptssbQ925E8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
SptssbQ925E8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms