Protein–RNA interactions for Protein: Q923W1

Tgs1, Trimethylguanosine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgs1Q923W1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tgs1Q923W1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tgs1Q923W1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms