Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csmd1Q923L3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms