Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubb6Q922F4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubb6Q922F4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms