Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smarca5Q91ZW3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Smarca5Q91ZW3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms