Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snx4Q91YJ2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Snx4Q91YJ2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms