Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Usb1Q91W78 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Usb1Q91W78 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms