Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Klc3Q91W40 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Klc3Q91W40 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klc3Q91W40 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klc3Q91W40 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klc3Q91W40 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klc3Q91W40 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Klc3Q91W40 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klc3Q91W40 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klc3Q91W40 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klc3Q91W40 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Klc3Q91W40 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms