Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW3

Sh3bgrl3, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrl3Q91VW3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Sh3bgrl3Q91VW3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Sh3bgrl3Q91VW3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bgrl3Q91VW3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bgrl3Q91VW3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bgrl3Q91VW3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bgrl3Q91VW3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bgrl3Q91VW3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bgrl3Q91VW3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Sh3bgrl3Q91VW3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sh3bgrl3Q91VW3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms