Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cabp4Q8VHC5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cabp4Q8VHC5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cabp4Q8VHC5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms