Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Cul7Q8VE73 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Cul7Q8VE73 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms