Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD72

Ttc8, Tetratricopeptide repeat protein 8, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc8Q8VD72 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc8Q8VD72 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc8Q8VD72 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc8Q8VD72 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc8Q8VD72 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ttc8Q8VD72 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttc8Q8VD72 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttc8Q8VD72 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttc8Q8VD72 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ttc8Q8VD72 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ttc8Q8VD72 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ttc8Q8VD72 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms