Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4C2

Rufy2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy2Q8R4C2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy2Q8R4C2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy2Q8R4C2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy2Q8R4C2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy2Q8R4C2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy2Q8R4C2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy2Q8R4C2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy2Q8R4C2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy2Q8R4C2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy2Q8R4C2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy2Q8R4C2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rufy2Q8R4C2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy2Q8R4C2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy2Q8R4C2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy2Q8R4C2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy2Q8R4C2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy2Q8R4C2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy2Q8R4C2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy2Q8R4C2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rufy2Q8R4C2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rufy2Q8R4C2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms