Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc58Q8R3Q6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms