Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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Vmn1r200Q8R281 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r200Q8R281 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r200Q8R281 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r200Q8R281 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r200Q8R281 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r200Q8R281 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r200Q8R281 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r200Q8R281 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r200Q8R281 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r200Q8R281 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Vmn1r200Q8R281 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r200Q8R281 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r200Q8R281 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r200Q8R281 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Vmn1r200Q8R281 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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Vmn1r200Q8R281 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Vmn1r200Q8R281 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
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Vmn1r200Q8R281 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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Vmn1r200Q8R281 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Vmn1r200Q8R281 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Vmn1r200Q8R281 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Vmn1r200Q8R281 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vmn1r200Q8R281 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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