Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3A0

Hscb, Iron-sulfur cluster co-chaperone protein HscB, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HscbQ8K3A0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HscbQ8K3A0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HscbQ8K3A0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms