Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc12Q8K2L8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc12Q8K2L8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms