Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Neil3Q8K203 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Neil3Q8K203 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms