Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Polr1eQ8K202 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Polr1eQ8K202 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms