Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnma3Q8JZW8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pnma3Q8JZW8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pnma3Q8JZW8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pnma3Q8JZW8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pnma3Q8JZW8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pnma3Q8JZW8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Pnma3Q8JZW8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms